在第一阶段进行大脑深入开发成功后，对人的自身能力产生了质变，轰动一时。正因为这样的成果，开发成武器几乎成为必然的趋势，当然不能让民众知道，这是最开始的前提。
在原来开发程序的基础上进行改进，从不同的一个角度和方向对人的大脑进行开发，配合当时比其他方面更加先进上几十年的科学技术，成功研究出进一步激发人大脑潜能的方法，而被开发成功的人，便多了一种激发态的物质，它的作用似乎很顺理成章的成为武装方面研发的必要物质。
通过这种介质，人体能够产生出一种能用意识控制的，来自大脑皮层的“第三层”开发区的物质，科学家命名其为精神源（Spiritual source），而通过这种精神源产生的能力，便被称为“精神武装”（Spirit armed）。它能依附在武器上，作为一种增幅，也可以成为一堵由精神源构成的力墙，能抵挡一定强度的攻击。
而最重要的是，这种攻击能攻击对方的精神，而攻击强度除了看武器外，还需要看个人的意识强度。
而所谓的非法开发，因为真正能掌握核心技术几个必要的细节的那几名科学家被牢牢地看管着，他们根本无法离开研究所。而被黑帮天价拉拢的科学家并没有好好的掌握这个极其重要的细节，他对开发后的安全性和稳定性有很重要的作用。
因此，接受非法开发的人，虽然能获得更强一点的力量，但因为大脑皮层的边缘叶区域受到波及，哪怕只是轻微的损伤，后遗症便是会产生了情绪反应的不安定，内脏功能结构的协调性波动范围增大，精神上的影响，风险比正规的要高出好几倍。
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