百万进化，或Mega进化（日文︰メガシンカ，英文︰MegaEvolution）是一种首次出现在第六世代，只发生在对战过程中的暫時性进化。然而並非所有的神奇宝贝都能百万进化，这种进化目前僅出现在特定的神奇宝贝身上。
要進行百萬進化，必須在对战之前，由該神奇寶貝携带相對應的百万石(Megastone)，也要有一定的亲密度。战斗时，主人公以食指和中指觸碰另一手手腕上百万环(Megaring)中的键石（Keystone)，和神奇宝贝身上所携带的百万石产生共鸣，使神奇宝贝在該回合對戰雙方出招之前发生百万进化。條件方面，在每場對戰中，主人公的队伍只能有一隻神奇宝贝发生百万进化，但队伍里可以存在多只携带百万石的神奇宝贝，在对战未结束之前，百万神奇宝贝無法变回原来的样子，就算交換也一樣，且即使該百萬神奇寶貝瀕死，其他神奇寶貝也無法進行百萬進化，復活後也只能恢復一般狀態，無法再次進行百萬進化。对战结束后，百万进化的神奇宝贝將会恢复原样。
通过百萬石进化后的神奇宝贝（除胡地外）種族值上升100、属性、特性都可能會有所改变。
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