公元2115年圣诞节夜，世界各地突然飘下黑色的雪花，黑色雪花一旦直接接触人体，便会渗入人体，强行与体细胞融合，并且附带着常人难以忍受的剧痛，圣诞夜过后，世界人口锐减20亿。
此次未知事件被联合国称为世界性灾难BlackChristmas：黑色的圣诞节。
然而“黑色的圣诞节”过后，直接接触黑色雪花，但是仍有极少数人类存活了下来，这些人被称为“黑色的幸存者”，而且无一例外都是少年少女，然而令人吃惊的是，这些少年少女们觉醒了一种可以凭借意念召唤强大兵器的能力。
联合国为了保护并研究这些少年少女，建立“黑色圣诞节对策组织”（BlackChristmasMeasuresOrganization，简称“BCMO”。）在太平洋上建立起一座占地六万平方公里的人工岛屿，并在上面建立了一所专门接收这些“黑色的幸存者”的学院——西尔维亚斯学院。
西尔维亚斯学院以保证学生的正常生活以及开发研究学生的能力为主，决策机构——十三人议会，由美国、中国、俄罗斯、日本等国家派出的代表组成，并宣布西尔维亚斯学院与西尔维亚斯学院的学生不隶属于任何一个国家，而属于“BCMO”直接管理。
“黑色的圣诞节”过后，莫非与黎夏奇迹般的存活下来，莫非与黎夏约定好，互相隐藏了对方是“黑色幸存者”的身份，继续过着普通人的生活，然而不久后黎夏神秘的失踪，莫非一直在寻找黎夏的下落，但是毫无头绪。
两年后，刚刚考上大学的莫非收到了来自署名为“黎夏”的信，里面虽然是白纸一张，但是附带着自己曾经送给黎夏的白金吊坠“维纳斯之泪”，莫非为了寻找黎夏的下落，向“BCMO”公布了自己的身份，随即被带到了书信的寄出地——坐落在太平洋中央的西尔维亚斯学院。
故事从这所西尔维亚斯学院开始......
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